Bu ətraflı müqayisə, genetik replikasiya və ifadədən məsul olan əsas fermentlər olan RNT və DNT polimerazları arasındakı fundamental fərqləri araşdırır. Hər ikisi polinukleotid zəncirlərinin əmələ gəlməsini katalizləşdirsə də, struktur tələbləri, səhv düzəltmə qabiliyyətləri və hüceyrənin mərkəzi dogması daxilindəki bioloji rolları baxımından əhəmiyyətli dərəcədə fərqlənir.
Seçilmişlər
RNT polimeraza, astar tələb etmədən yeni RNT sintez edir.
DNT polimerazası bir primer tələb edir, lakin yüksək dəqiqlik üçün üstün korrektura təklif edir.
RNT polimerazasının son məhsulu tək zəncirlidir, DNT polimeraza isə ikiqat spiral əmələ gətirir.
RNT polimeraza, DNT polimerazasında olmayan daxili DNT açma qabiliyyətinə malikdir.
RNT Polimeraza nədir?
Gen ifadəsi zamanı DNT-ni müxtəlif növ RNT molekullarına çevirməkdən məsul olan ferment.
Əsas funksiya: RNT transkripsiyası
Substrat: Ribonukleozid trifosfatlar (NTP-lər)
Astar Tələbi: Yoxdur (de novo sintez)
Əsas növləri: Pol I, Pol II və Pol III (ökaryotlarda)
Məhsul: Tək zəncirli RNT
DNT Polimeraza nədir?
Ferment bölünmə zamanı dəqiq genetik irsi təmin etmək üçün hüceyrənin genomunu kopyalamaq vəzifəsini daşıyırdı.
Əsas növləri: Pol I, II, III, IV və V (prokaryotlarda)
Məhsul: İkiqat zəncirli DNT
Müqayisə Cədvəli
Xüsusiyyət
RNT Polimeraza
DNT Polimeraza
Bioloji Proses
Transkripsiya
Replikasiya
Şablon istifadə olunub
İkiqat zəncirli DNT
Tək zəncirli DNT
Astar Lazımdır
Xeyr
Bəli
Korrektura bacarığı
Minimal/Məhdud
Geniş (3'-5' ekzonukleaza)
Məhsuldakı şəkər
Riboza
Deoksiriboza
Rahatlama Fəaliyyəti
Helikaza bənzər qabiliyyət
Ayrı bir helikaz fermenti tələb edir
Xəta dərəcəsi
10.000 nukleotiddən 1-i
1.000.000.000 nukleotiddən 1-i
Son Məhsul Quruluşu
Tək polinukleotid zəncir
İkiqat zəncirli spiral
Ətraflı Müqayisə
Başlanğıc və İlkin Tələblər
Əsas fərq bu fermentlərin sintezə necə başlamasındadır. RNT polimeraza promotor ardıcıllığına bağlandıqdan sonra sıfırdan yeni bir zəncir yaratmağa başlaya bilər. Əksinə, DNT polimeraza zənciri başlada bilmir və ilk nukleotidi əlavə etmək üçün sərbəst 3'-OH qrupu olan əvvəlcədən mövcud olan bir primer tələb edir.
Dəqiqlik və Korrektura
DNT polimeraza bütün genomun bütövlüyünü qoruyur və daxili korrektura mexanizmləri vasitəsilə əldə edilən inanılmaz dərəcədə aşağı səhv nisbətini tələb edir. RNT polimerazasında bu yüksək dəqiqlikli ekzonukleaza aktivliyi yoxdur və bu da mutasiya nisbətinin xeyli yüksək olmasına səbəb olur. Lakin, RNT keçici olduğundan və irsi olmadığından, bu səhvlər ümumiyyətlə orqanizm üçün daha az zərərlidir.
Struktur Açılma Funksiyaları
Transkripsiya zamanı RNT polimeraza şablona daxil olmaq üçün DNT ikiqat spiralını öz-özünə aça bilən müstəqil bir maşın kimi çıxış edir. DNT polimeraza daha çox zülal kompleksindən asılıdır, xüsusən də hidrogen rabitələrini qırmaq və qarşısındakı replikasiya çəngəlini açmaq üçün ferment helikaza tələb edir.
Substratın Xüsusiyyəti
Fermentlər istifadə etdikləri tikinti blokları ilə bağlı yüksək seçiciliyə malikdirlər. RNT polimeraza riboza şəkəri və əsas urasil ehtiva edən ribonukleotidləri özündə birləşdirir. DNT polimeraza xüsusilə urasil əvəzinə deoksiriboza şəkəri və timin ehtiva edən deoksiribonukleotidləri seçir.
Üstünlüklər və Eksikliklər
RNT Polimeraza
Üstünlüklər
+Müstəqil təşəbbüs
+Sürətli transkripsiya
+Daxili DNT-nin açılması
+Çoxlu RNT növləri
Saxlayıcı
−Daha yüksək səhv nisbəti
−Güclü korrekturaya malik deyil
−Aşağı sabitlik
−Keçici məhsullar
DNT Polimeraza
Üstünlüklər
+Həddindən artıq dəqiqlik
+Güclü korrektə
+Daimi genetik saxlama
+Yüksək prosessorluq
Saxlayıcı
−Astar tələb edir
−Köməkçi fermentlər tələb edir
−Daha yavaş başlanğıc
−Kompleks təmir yolları
Yaygın yanlış anlaşılmalar
Əfsanə
RNT polimeraza və DNT polimeraza eyni sürətlə işləyir.
Həqiqət
Əksər orqanizmlərdə DNT polimeraza əhəmiyyətli dərəcədə daha sürətlidir və bakteriyalarda saniyədə təxminən 1000 nukleotid sürətlə hərəkət edir, RNT polimeraza isə orta hesabla saniyədə 40-80 nukleotidə yaxındır. Bu fərq, bütün bir genomun replikasiyasının spesifik genlərin transkripsiyası ilə müqayisədə nəhəng miqyasını əks etdirir.
Əfsanə
Bütün hüceyrələrdə yalnız bir növ RNT polimeraza mövcuddur.
Həqiqət
Bakteriyalar adətən bir çoxaltımlı RNT polimerazasına malik olsalar da, eukaryotlar ən azı üç fərqli növə malikdir. Hər bir eukaryot RNT polimerazası ribosomal RNT, mesajçı RNT və ya transfer RNT-nin sintezi kimi müxtəlif vəzifələr üçün ixtisaslaşmışdır.
Əfsanə
DNT polimeraza yalnız replikasiya zamanı səhvləri düzəldə bilər.
Həqiqət
Müxtəlif ixtisaslaşmış DNT polimerazları yalnız hüceyrənin həyatı boyunca zədələnməni bərpa etmək üçün mövcuddur. Bu fermentlər əsas replikasiya dövründən asılı olmayaraq fəaliyyət göstərərək UB işığının və ya kimyəvi təsirin yaratdığı boşluqları doldura bilər.
Əfsanə
RNT polimeraza ikiqat zəncirli RNT istehsal edir.
Həqiqət
RNT polimeraza, iki DNT şablon zəncirindən yalnız birini oxuyaraq tək zəncirli bir molekul yaradır. Bəzi RNT-lər yerli iki zəncirli strukturlar yaratmaq üçün öz üzərinə geri qatlana bilsə də, ilkin çıxış tək polinukleotid zənciridir.
Tez-tez verilən suallar
DNT polimeraza kömək olmadan yeni bir zəncir yarada bilərmi?
Xeyr, DNT polimeraza öz-özünə sintezə başlaya bilməz, çünki daxil olan nukleotidi birləşdirmək üçün əvvəlcədən mövcud olan 3'-OH qrupuna ehtiyac duyur. Təbiətdə primaz adlanan bir ferment bu başlanğıc nöqtəsini təmin edən qısa bir RNT praymeri yaradır. Praymer yerində olduqdan sonra DNT polimeraza zənciri uzatmağa başlaya bilər.
Hansı ferment daha dəqiqdir və nə üçün?
DNT polimeraza daha dəqiqdir və səhv nisbəti RNT polimerazadan təxminən 100.000 dəfə aşağıdır. Bu yüksək dəqiqlik, onun 3'-5' ekzonukleaza aktivliyi ilə əlaqədardır ki, bu da ona "geriyə" keçməyə və səhv qoşalaşmış əsasları silməyə imkan verir. RNT polimerazasında bu ciddi korrektura yoxdur, çünki bir neçə nasaz RNT molekulu genomdakı daimi mutasiyadan daha az fəlakətlidir.
RNT polimerazasının DNT-ni açması üçün helikaza ehtiyacı varmı?
DNT polimerazadan fərqli olaraq, RNT polimeraza DNT spiralını açmaq üçün ayrıca bir helikaza fermenti tələb etmir. Gen boyunca hərəkət edərkən DNT şablonunu açmağa imkan verən daxili mexanizmə malikdir. Bu, fermentlə birlikdə hərəkət edən transkripsiya qabarcığı kimi tanınan bir mexanizmi əmələ gətirir.
RNT polimeraza səhv etsə nə baş verər?
Transkripsiya zamanı səhv baş verərsə, bu, qüsurlu RNT molekuluna və potensial olaraq funksional olmayan bir zülala səbəb olur. Lakin, tək bir gen dəfələrlə transkripsiya edildiyi üçün hüceyrədə adətən zülalın bir çox digər düzgün nüsxələri olur. Qüsurlu RNT nəticədə parçalanır, buna görə də səhv orqanizmin genetik kodunun daimi bir hissəsinə çevrilmir.
Niyə DNT polimeraza timin istifadə edir, RNT polimeraza isə urasil istifadə edir?
DNT-də timin istifadəsi mutasiyaya qarşı təkamül yolu ilə təminatdır. Sitozin kortəbii olaraq urasilə deaminasiya oluna bilər; əgər DNT təbii olaraq urasil istifadə etsəydi, hüceyrə orada bir urasil əsasının olması lazım olduğunu və ya zədələnmiş bir sitozinin olduğunu deyə bilməzdi. DNT-də timin istifadə etməklə, hüceyrə genetik bütövlüyünü qoruyaraq ortaya çıxan hər hansı bir urasili asanlıqla müəyyən edə və bərpa edə bilər.
Eukaryotik RNT polimerazlarının üç növü hansılardır?
Ökaryotlar əksər ribosomal RNT-ni (rRNT) sintez etmək üçün RNT Polimeraza I-dən, messenger RNT (mRNT) və bəzi kiçik RNT-lər üçün RNT Polimeraza II-dən, transfer RNT (tRNT) və digər kiçik struktur RNT-lər üçün isə RNT Polimeraza III-dən istifadə edirlər. Hər bir ferment spesifik promotor ardıcıllıqlarını tanıyır və işləməsi üçün fərqli transkripsiya amillərini tələb edir. Bu ixtisaslaşma gen ifadəsinin daha mürəkkəb tənzimlənməsinə imkan verir.
RNT polimeraza hər iki istiqamətdə hərəkət edə bilərmi?
Xeyr, həm RNT, həm də DNT polimerazaları tamamilə biristiqamətlidir və yeni zəncirləri yalnız 5'-dən 3'-ə qədər istiqamətdə sintez edirlər. Bu o deməkdir ki, onlar şablon zəncirini 3'-dən 5'-ə qədər istiqamətdə oxuyurlar. Bu istiqamət məhdudiyyəti, mövcud zəncirin 3' hidroksil qrupunun daxil olan nukleotidin fosfat qrupuna hücum etməsini tələb edən reaksiyanın kimyəvi mexanizmindən qaynaqlanır.
DNT polimeraza transkripsiyada iştirak edirmi?
Xeyr, DNT polimeraza yalnız DNT replikasiyası və DNT təmirində iştirak edir. RNT polimerazasının sahəsi olan transkripsiya prosesində heç bir rol oynamır. İki ferment quruluşlarına və DNT molekulundakı fərqli başlanğıc siqnallarını tanıma qabiliyyətlərinə görə fərqlidir.
Bu fermentlər haradan başlayacaqlarını haradan bilirlər?
RNT polimeraza, genin başlanğıcını siqnal edən promotor adlanan spesifik DNT ardıcıllıqlarını müəyyən edir. Lakin DNT polimeraza "replikasiyanın mənşəyi" adlanan spesifik yerlərdə başlayır. RNT polimeraza transkripsiya amillərinin köməyi ilə öz başlanğıc nöqtəsini taparkən, DNT polimeraza primazanın replikasiya çəngəlində bir primer qoymasını gözləməlidir.
PCR-də (Polimeraz Zəncir Reaksiyası) hansı ferment istifadə olunur?
PCR, xüsusilə termofil bakteriyalardan əldə edilən Taq polimerazası kimi istiliyədavamlı bir DNT polimerazasından istifadə edir. Bu, fermentin dövr prosesi zamanı DNT tellərini denaturasiya etmək üçün lazım olan yüksək temperaturlara tab gətirməsinə imkan verir. RNT polimeraza standart PCR-də istifadə olunmasa da, in vitro transkripsiya kimi digər üsullarda istifadə olunur.
Hökm
Gen ifadəsi və zülal sintezi yollarını öyrənərkən diqqət mərkəzində RNT polimerazanı seçin. Hüceyrə bölünməsi, irsiyyət və uzunmüddətli genetik sabitlik mexanizmlərini təhlil edərkən DNT polimerazasını seçin.