Šajā salīdzinājumā tiek pētīti divi secīgi olbaltumvielu sintēzes posmi: translācija, mRNS dekodēšanas process polipeptīdu ķēdē, un olbaltumvielu locīšanās, šīs ķēdes fiziska pārveidošana funkcionālā trīsdimensiju struktūrā. Šo atšķirīgo fāžu izpratne ir ļoti svarīga, lai izprastu, kā ģenētiskā informācija izpaužas kā bioloģiskā aktivitāte.
Iezīmes
Pārvietošana veido ķēdi; locīšana rada instrumentu.
Ribosomas ir tulkošanas rūpnīcas, savukārt šaperoni ir locīšanas kvalitātes kontrole.
Ģenētiskais kods beidzas ar translāciju, savukārt fizikālā ķīmija nosaka locīšanos.
Olbaltumviela netiek uzskatīta par “nobriedušu”, kamēr tā nav veiksmīgi pabeigusi locīšanās procesu.
Kas ir Tulkojums?
Šūnu process, kurā ribosomas dekodē kurjera RNS (mRNS), lai saliktu noteiktu aminoskābju secību.
Atrašanās vieta: Ribosomas (citoplazma/RER)
Ievade: mRNS, tRNS, aminoskābes
Galvenā sastāvdaļa: ribosomu RNS (rRNS)
Rezultāts: Lineāra polipeptīdu ķēde
Virziens: no N-gala uz C-galu
Kas ir Olbaltumvielu locīšana?
Fizisks process, kurā polipeptīdu ķēde iegūst tai raksturīgo un funkcionālo trīsdimensiju formu.
Atrašanās vieta: citoplazma vai endoplazmatiskais tīkls
Virzošais spēks: hidrofobās mijiedarbības
Palīdz: šaperona proteīni
Rezultāts: Nobriedis, funkcionāls proteīns
Struktūra: primārā līdz terciārā/kvaternārā
Salīdzinājuma tabula
Funkcija
Tulkojums
Olbaltumvielu locīšana
Primārais mehānisms
Kovalentās peptīdu saites veidošanās
Nekovalenti intramolekulārie spēki
Informācijas avots
mRNS nukleotīdu secība
Aminoskābju sānu ķēdes īpašības
Šūnu mašīna
Ribosoma
Šaperonīni (bieži nepieciešami)
Atslēgas izvade
Polipeptīds (primārā struktūra)
Konformācija (3D struktūra)
Enerģijas prasības
Augsts (GTP patēriņš)
Spontāna vai ATP asistēta
Bioloģiskais mērķis
Secības montāža
Funkcionālā aktivācija
Detalizēts salīdzinājums
Secības montāža pret formas iegūšanu
Translācija ir bioķīmisks process, kurā aminoskābes tiek savienotas kopā, pamatojoties uz mRNS atrodamo ģenētisko kodu. Olbaltumvielu locīšanās ir sekojošais biofizikālais process, kurā šī lineārā aminoskābju virkne sagriežas un liecas noteiktā formā. Lai gan translācija nosaka olbaltumvielu identitāti, locīšanās nosaka to faktiskās bioloģiskās spējas.
Molekulārie virzītājspēki
Translāciju virza ribosomas fermentatīvā aktivitāte un specifiskais mRNS kodonu un tRNS antikodonu savienojums pārī. Olbaltumvielu locīšanos lielā mērā virza termodinamika, īpaši "hidrofobiskais efekts", kur nepolārās sānu ķēdes slēpjas no ūdens, kā arī ūdeņraža saites un disulfīda tiltiņi, kas stabilizē galīgo formu.
Laiks un kopīga parādīšanās
Šie procesi bieži pārklājas parādībā, kas pazīstama kā kotranslācijas locīšanās. Translācijas laikā aminoskābju ķēdei izejot no ribosomas izejas tuneļa, ķēdes sākums var jau sākt locīties sekundārajās struktūrās, pirms visa secība ir pilnībā translēta.
Kļūdu sekas
Translācijas kļūdas parasti izraisa "bezjēdzīgas" vai "missense" mutācijas, kurās tiek ievietota nepareiza aminoskābe, kas potenciāli var novest pie nefunkcionējoša produkta. Salokšanās kļūdas vai nepareiza locīšanās var izraisīt toksisku agregātu vai prionu veidošanos, kas ir iesaistīti neirodeģeneratīvos stāvokļos, piemēram, Alcheimera vai Parkinsona slimībā.
Priekšrocības un trūkumi
Tulkojums
Iepriekšējumi
+Augstas precizitātes montāža
+Ātra aminoskābju saistīšana
+Universāls ģenētiskais kods
+Tieša mRNS nolasīšana
Ievietots
−Nepieciešama milzīga enerģija
−Atkarīgs no tRNS pieejamības
−Ierobežots ar ribosomu ātrumu
−Neaizsargāts pret antibiotikām
Olbaltumvielu locīšana
Iepriekšējumi
+Izveido funkcionālas vietnes
+Termodinamiski stabils
+Pašmontējoša daba
+Nodrošina sarežģītu signalizāciju
Ievietots
−Nosliece uz agregāciju
−Ļoti jutīga pret karstumu
−Jūtīgi pret pH izmaiņām
−Grūti prognozēt skaitļošanas ziņā
Biežas maldības
Mīts
Olbaltumvielas sāk locīties tikai pēc tam, kad viss translācijas process ir pabeigts.
Realitāte
Salocīšanās bieži sākas kotranslācijas ceļā. Polipeptīda N-gals sāk pieņemt sekundāras struktūras, piemēram, alfa spirāles, kamēr C-gals joprojām tiek montēts ribosomas iekšpusē.
Mīts
Katrs proteīns lieliski salocās pats no sevis, bez palīdzības.
Realitāte
Lai gan daži mazi proteīni salocās spontāni, daudziem sarežģītiem proteīniem ir nepieciešami "molekulārie šaperoni". Šie specializētie proteīni novērš nepabeigtās ķēdes salipšanu kopā vai nepareizu locīšanos pārpildītā šūnu vidē.
Mīts
Tulkošana ir pēdējais solis funkcionāla proteīna izveidē.
Realitāte
Translācija rada tikai primāro secību. Funkcionālajai briedumam ir nepieciešama locīšanās un bieži vien pēctranslācijas modifikācijas, piemēram, fosforilēšana vai glikozilēšana, lai kļūtu bioloģiski aktīva.
Mīts
Ja aminoskābju secība ir pareiza, proteīns vienmēr darbosies pareizi.
Realitāte
Pat perfekti translēta secība var neizdoties, ja tā nepareizi salocās. Vides stresori, piemēram, augsta temperatūra (karstuma šoks), var izraisīt pareizi sekvencētu olbaltumvielu formas un funkcijas zudumu.
Bieži uzdotie jautājumi
Kāda ir saistība starp translāciju un olbaltumvielu locīšanos?
Translācija un olbaltumvielu locīšanās ir secīgi, bet pārklājoši soļi gēnu ekspresijā. Translācija nodrošina izejvielu (aminoskābju secību), un locīšanās organizē šo materiālu funkcionējošā struktūrā. Bez translācijas nav ķēdes, ko locīt; bez locīšanās ķēde paliek neaktīva ķīmisko vielu virkne.
Vai translācija notiek kodolā?
Nē, eikariotu šūnās translācija notiek citoplazmā vai uz raupjā endoplazmatiskā tīkla virsmas. Pēc transkripcijas mRNS ir jāeksportē no kodola, pirms ribosomas var uzsākt translācijas procesu. Pēc tam locīšanās notiek tajos pašos nodalījumos, kur notiek translācija.
Kas ir šaperoni olbaltumvielu locīšanās kontekstā?
Šaperoni ir olbaltumvielu klase, kas palīdz pareizi salocīties citiem proteīniem. Tie nenodrošina formas plānu, bet gan aizsargā vidi, kas novērš nevēlamu mijiedarbību. Tie ir īpaši aktīvi šūnu stresa laikā, piemēram, augstas temperatūras ietekmē, lai novērstu olbaltumvielu denaturāciju.
Kā ribosoma zina, kad pārtraukt tulkošanu?
Ribosoma turpina translāciju, līdz tā mRNS ķēdē sastopas ar "stopkodonu" (UAA, UAG vai UGA). Šie kodoni nekodē aminoskābes, bet gan signalizē atbrīvošanas faktoriem iekļūt ribosomā, kas izraisa pabeigtās polipeptīdu ķēdes atbrīvošanu.
Kāds ir Levintāla paradokss olbaltumvielu locīšanās procesā?
Levintāla paradokss norāda, ka, ja olbaltumviela salocītos, nejauši atlasot visas iespējamās konformācijas, tai būtu nepieciešams ilgāks laiks nekā Visuma vecums, lai atrastu pareizo formu. Tomēr lielākā daļa olbaltumvielu salocās milisekundēs. Tas liecina, ka locīšanās notiek pa specifiskiem, virzītiem ceļiem, nevis nejaušas meklēšanas ceļā.
Vai nepareizi salocītu olbaltumvielu var labot?
Šūnām ir “kvalitātes kontroles” mehānismi, kuros šaperoni mēģina pārlocīt nepareizi salocītus proteīnus. Ja pārlocīt neizdodas, proteīns parasti tiek marķēts ar ubikvitīnu un nosūtīts uz proteasomu degradācijai. Ja šīs sistēmas ir pārslogotas, nepareizi salocīti proteīni var uzkrāties un izraisīt šūnu bojājumus.
Cik aminoskābju tiek pievienotas sekundē translācijas laikā?
Baktērijās ribosomas var pievienot aptuveni 15 līdz 20 aminoskābes sekundē. Cilvēka šūnās šis ātrums ir nedaudz lēnāks, parasti aptuveni 2 līdz 5 aminoskābes sekundē. Šis ātrums ļauj ātri ražot olbaltumvielas, kas nepieciešamas šūnu augšanai un reakcijai.
Kāda ir atšķirība starp “primāro struktūru” un “terciāro struktūru”?
Primārā struktūra ir aminoskābju lineāra secība, kas rodas translācijas laikā. Terciārā struktūra ir visu atomu visaptverošs trīsdimensiju izkārtojums vienā polipeptīdu ķēdē, kas ir olbaltumvielu locīšanās procesa gala rezultāts.
Spriedums
Izvēlieties tulkošanu (tulkošanu), pētot, kā ģenētiskais kods tiek pārveidots ķīmiskās secībās. Koncentrējieties uz olbaltumvielu locīšanos, pētot, kā olbaltumvielu forma ir saistīta ar to funkciju, enzīmu aktivitāti vai proteopātisko slimību cēloņiem.