Бул салыштыруу белок синтезинин эки ырааттуу этабын карап чыгат: трансляция, мРНКны полипептиддик чынжырчага декоддоо процесси жана белоктун бүктөлүшү, ал чынжырдын функционалдык үч өлчөмдүү түзүлүшкө физикалык трансформациясы. Бул айырмаланган фазаларды түшүнүү генетикалык маалыматтын биологиялык активдүүлүк катары кандайча көрүнөрүн түшүнүү үчүн абдан маанилүү.
Көрүнүктүү нерселер
Котормо чынжырды курат; бүктөө куралды жаратат.
Рибосомалар трансляциянын фабрикалары болсо, шаперондор бүктөлүүнүн сапатты көзөмөлдөөчү факторлору болуп саналат.
Генетикалык код трансляция менен аяктайт, ал эми физикалык химия бүктөлүүнү талап кылат.
Белок бүктөлүү процессин ийгиликтүү аяктамайынча "жетилген" деп эсептелбейт.
Котормо эмне?
Рибосомалар аминокислоталардын белгилүү бир ырааттуулугун чогултуу үчүн кабарчы РНКны (мРНК) декоддогон клеткалык процесс.
Жайгашкан жери: Рибосомалар (Цитоплазма/RER)
Киргизүү: мРНК, тРНК, аминокислоталар
Негизги компонент: Рибосомалык РНК (рРНК)
Чыгаруу: Сызыктуу полипептиддик чынжыр
Багыт: N-терминалынан C-терминалына
Протеиндин бүктөлүшү эмне?
Полипептид чынжыры өзүнүн мүнөздүү жана функционалдык үч өлчөмдүү формасын алган физикалык процесс.
Жайгашкан жери: Цитоплазма же эндоплазмалык торчо
Кыймылдаткыч күч: Гидрофобдук өз ара аракеттенүүлөр
Жардам берген: Шаперон белоктору
Чыгаруу: Жетилген, функционалдуу белок
Түзүлүшү: Башталгычтан үчүнчү/төртүнчү баскычка чейин
Салаштыруу таблицасы
Мүмкүнчүлүк
Котормо
Протеиндин бүктөлүшү
Негизги механизм
Коваленттик пептиддик байланыштын пайда болушу
Коваленттик эмес молекула ичиндеги күчтөр
Маалымат булагы
мРНК нуклеотиддик ырааттуулугу
Аминокислоталардын каптал чынжырынын касиеттери
Уюлдук машина
Рибосома
Шаперониндер (көбүнчө талап кылынат)
Ачкыч чыгаруу
Полипептид (баштапкы түзүлүш)
Конформация (3D түзүлүш)
Энергияга болгон талап
Жогорку (GTP керектөөсү)
Өзүнөн-өзү же АТФ жардамы менен
Биологиялык максат
Ырааттуулукту чогултуу
Функционалдык активдештирүү
Толук салыштыруу
Ырааттуулукту чогултуу жана форманы алуу
Трансляция – бул мРНКда кездешкен генетикалык кодго негизделген аминокислоталарды бириктирүүнүн биохимиялык процесси. Белоктун бүктөлүшү – бул андан кийинки биофизикалык процесс, мында аминокислоталардын сызыктуу тизмеги бурулуп, белгилүү бир формага ийилет. Трансляция белоктун өздүгүн аныктаса, бүктөлүшү анын чыныгы биологиялык жөндөмүн аныктайт.
Молекулярдык кыймылдаткычтар
Трансляция рибосоманын ферменттик активдүүлүгү жана мРНК кодондору менен тРНК антикодондорунун ортосундагы өзгөчө жупташуу менен шартталат. Белоктун бүктөлүшү көбүнчө термодинамика менен, атап айтканда, полярдуу эмес каптал чынжырлар суудан жашырынган "гидрофобдук эффект", ошондой эле акыркы форманы турукташтыруучу суутек байланыштары жана дисульфиддик көпүрөлөр менен шартталат.
Убакыт жана биргелешип пайда болуу
Бул процесстер көбүнчө ко-трансляциялык бүктөлүш деп аталган кубулушта бири-бирине дал келет. Трансляция учурунда аминокислота чынжыры рибосоманын чыгуу туннелинен чыкканда, чынжырдын башталышы бүтүндөй ырааттуулук толугу менен которула электе эле экинчилик түзүлүштөргө бүктөлө башташы мүмкүн.
Каталардын кесепеттери
Котормодогу каталар, адатта, туура эмес аминокислота киргизилген "маанисиз" же "миссенс" мутацияларына алып келет, бул функционалдык эмес продуктка алып келиши мүмкүн. Бүктөлүүчү каталар же туура эмес бүктөлүүлөр уулуу агрегаттардын же приондордун пайда болушуна алып келиши мүмкүн, алар Альцгеймер же Паркинсон оорусу сыяктуу нейродегенеративдик ооруларга алып келет.
Артыкчылыктары жана кемчиликтери
Котормо
Артыкчылыктары
+Жогорку тактыктагы чогултуу
+Тез аминокислота байланышы
+Универсалдуу генетикалык код
+Түз мРНК окуусу
Конс
−Чоң энергияны талап кылат
−тРНКнын болушуна жараша
−Рибосоманын ылдамдыгы менен чектелген
−Антибиотиктерге алсыз
Протеиндин бүктөлүшү
Артыкчылыктары
+Функционалдык сайттарды түзөт
+Термодинамикалык жактан туруктуу
+Өзүн-өзү чогултуу мүнөзү
+Татаал сигнал берүүнү иштетет
Конс
−Агрегацияга жакын
−Ысыкка өтө сезгич
−рН өзгөрүүлөрүнө сезгич
−Эсептөө жолу менен алдын ала айтуу кыйын
Жалпы каталар
Мит
Белоктор бүтүндөй которуу процесси аяктагандан кийин гана бүктөлө баштайт.
Чындык
Бүктөө көбүнчө ко-трансляциялык түрдө башталат. Полипептиддин N-терминалы альфа-спиральдар сыяктуу экинчилик түзүлүштөрдү кабыл ала баштайт, ал эми С-терминалы рибосоманын ичинде чогулуп жатат.
Мит
Ар бир белок эч кандай жардамсыз өз алдынча кемчиликсиз бүктөлөт.
Чындык
Кээ бир майда белоктор өзүнөн-өзү бүктөлсө, көптөгөн татаал белоктор «молекулярдык шаперондорду» талап кылат. Бул адистештирилген белоктор бүтпөгөн чынжырдын тыгыз клеткалык чөйрөдө бири-бирине жабышып же туура эмес бүктөлүшүнө жол бербейт.
Мит
Трансляция - бул функционалдык белокту түзүүнүн акыркы кадамы.
Чындык
Трансляция биринчилик ырааттуулукту гана түзөт. Функционалдык жетилүү биологиялык жактан активдүү болуу үчүн бүктөлүүнү жана көп учурда фосфорлануу же гликозилдөө сыяктуу трансляциядан кийинки модификацияларды талап кылат.
Мит
Эгерде аминокислоталардын ырааттуулугу туура болсо, белок ар дайым туура иштейт.
Чындык
Атүгүл кемчиликсиз которулган ырааттуулук туура эмес бүктөлсө, иштебей калышы мүмкүн. Жогорку температура (жылуулук шоку) сыяктуу экологиялык стресс факторлору туура ыраатталган белоктордун формасын жана функциясын жоготушуна алып келиши мүмкүн.
Көп суралуучу суроолор
Трансляция менен белоктун бүктөлүшүнүн ортосунда кандай байланыш бар?
Трансляция жана белоктун бүктөлүшү ген экспрессиясындагы ырааттуу, бирок бири-бирине дал келген кадамдар. Трансляция чийки затты (аминокислоталардын ырааттуулугун) камсыз кылат, ал эми бүктөлүш ал материалды жумушчу түзүлүшкө уюштурат. Трансляциясыз бүктөлө турган чынжыр жок; бүктөлбөсө, чынжыр химиялык заттардын активдүү эмес тизмеги бойдон калат.
Трансляция ядродо болобу?
Жок, эукариоттук клеткаларда трансляция цитоплазмада же одоно эндоплазмалык торчонун бетинде жүрөт. Рибосомалар трансляция процессин баштаардан мурун, транскрипциядан кийин мРНК ядродон экспорттолушу керек. Андан кийин бүктөө трансляция жүргөн ошол эле бөлүмдөрдө болот.
Белоктун бүктөлүшү контекстинде шаперондор деген эмне?
Шаперондор – бул башка белоктордун туура бүктөлүшүнө жардам берүүчү белоктордун бир классы. Алар форманын планын түзбөйт, тескерисинче, туура эмес өз ара аракеттенүүнүн алдын алуучу корголгон чөйрөнү камсыз кылат. Алар, айрыкча, клеткалык стресс учурунда, мисалы, жогорку температурада, белоктун денатурациясынын алдын алуу үчүн активдүү болушат.
Рибосома трансляцияны качан токтотуу керектигин кантип билет?
Рибосома трансляцияны мРНК тизмегинде "стоп-кодонго" (UAA, UAG же UGA) туш болгонго чейин улантат. Бул кодондор аминокислоталарды коддобойт, тескерисинче, рибосомага кирүү үчүн сигнал берүүчү бөлүп чыгаруу факторлорун иштетет, бул аяктаган полипептид чынжырынын бөлүнүп чыгышын шарттайт.
Левинтальдын парадоксунда эгерде белок бардык мүмкүн болгон конформацияларды кокустук түрдө тандап алуу менен бүктөлсө, анын туура формасын табуу үчүн ааламдын жашынан көбүрөөк убакыт талап кылынары белгиленген. Бирок, көпчүлүк белоктор миллисекундда бүктөлөт. Бул бүктөлүү кокустук издөөнүн ордуна белгилүү бир, багытталган жолдор менен жүрөрүн көрсөтүп турат.
Туура эмес бүктөлгөн белокту калыбына келтирүүгө болобу?
Клеткаларда шаперондор туура эмес бүктөлгөн белокторду кайра бүктөөгө аракет кылган "сапатты көзөмөлдөө" механизмдери бар. Эгерде кайра бүктөө ишке ашпаса, белок адатта убиквитин менен белгиленип, деградация үчүн протеасомага жөнөтүлөт. Эгерде бул системалар ашыкча жүктөлсө, туура эмес бүктөлгөн белоктор топтолуп, клеткаларга зыян келтириши мүмкүн.
Трансляция учурунда секундасына канча аминокислота кошулат?
Бактерияларда рибосомалар секундасына 15тен 20га чейин аминокислота кошо алышат. Адам клеткаларында бул ылдамдык бир аз жайыраак, адатта секундасына 2ден 5ке чейин аминокислота кошот. Бул ылдамдык клеткалардын өсүшү жана реакциясы үчүн керектүү белоктордун тез өндүрүлүшүнө мүмкүндүк берет.
"Баштапкы түзүлүш" жана "үчүнчүлүк түзүлүш" деген эмне?
Биринчилик түзүлүш – бул трансляция учурунда пайда болгон аминокислоталардын сызыктуу ырааттуулугу. Үчүнчүлүк түзүлүш – бул белоктун бүктөлүшү процессинин акыркы натыйжасы болгон бир полипептиддик чынжырдагы бардык атомдордун комплекстүү үч өлчөмдүү жайгашуусу.
Чыгарма
Генетикалык коддун химиялык ырааттуулукка кантип айландырыларын изилдеп жатканда Котормону тандаңыз. Белоктун формасы анын функциясына, ферменттик активдүүлүгүнө же протеопатия ооруларынын себептерине кандайча байланыштуу экенин изилдеп жатканда белоктун бүктөлүшүнө көңүл буруңуз.