Бул салыштыруу организмдин бүтүндөй генетикалык планын изилдөөчү геномика менен клетка тарабынан экспрессияланган белоктордун толук жыйындысын талдоочу протеомиканын ортосундагы негизги айырмачылыктарды изилдейт. Геномика негизги кодду берсе, протеомика биологиялык системалардын айлана-чөйрөгө болгон реакциясындагы динамикалык функционалдык абалын ачып берет.
Организмдин бардык гендерин жана алардын иерархиялык картасын камтыган ДНКнын толук жыйындысын комплекстүү изилдөө.
Протеомдорду кеңири масштабдуу изилдөө, алар организм же система тарабынан өндүрүлгөн же өзгөртүлгөн белоктордун толук жыйындысы.
| Мүмкүнчүлүк | Геномика | Протеомика |
|---|---|---|
| Молекулярдык максат | Дезоксирибонуклеин кислотасы (ДНК) | Белоктор (полипептиддик чынжырлар) |
| Убакыттын өзгөрүшү | Убакыттын өтүшү менен туруктуу жана туруктуу | Клетканын абалына жараша тез өзгөрөт |
| Татаалдык деңгээли | Сызыктуу жана салыштырмалуу алдын ала айтууга болот | Өзгөртүүлөргө байланыштуу өтө жогору |
| Маалымат агымы | "Көрсөтмө" же чийме | Клетканын "функционалдык механизми" |
| Негизги технология | ДНКнын секвенирлениши / ПЦР | Массалык спектрометрия / 2D-PAGE |
| Өлчөмдүн өзгөрмөлүүлүгү | Белгилүү бир түр үчүн бекитилген | Клетка түрлөрүнүн ортосунда бир топ айырмаланат |
| Айлана-чөйрөнүн таасири | Ырааттуулукка минималдуу түз таасир | Эмоцияга жана бүктөлүүгө түздөн-түз таасир этет |
Геномика организмдин толук, тукум куучулук генетикалык ырааттуулугун изилдейт, ал ар бир клеткада жана адамдын өмүр бою бирдей бойдон калат. Ал эми протеомика белгилүү бир учурда белгилүү бир клеткада болгон белокторду карайт. Белоктор тынымсыз синтезделип жана ажырап тургандыктан, протеом туруктуу план эмес, активдүүлүктүн сүрөтү болуп саналат.
Геномду талдоо салыштырмалуу оңой, анткени ал сызыктуу түрдө жайгашкан төрт нуклеотиддик негизден турат. Протеомика бир топ татаал, анткени бир ген альтернативдик сплайсинг аркылуу бир нече белок варианттарын пайда кыла алат. Мындан тышкары, белоктор фосфорлануу сыяктуу посттрансляциялык модификацияларга дуушар болушат, бул алардын функциясын кескин өзгөртөт жана протеомдун ар түрдүүлүгүн жогорулатат.
Геномдук изилдөөлөр миллиондогон ДНК фрагменттерин бир эле учурда окуй алган жогорку өндүрүмдүүлүктөгү секвенирлөө технологияларына абдан таянат. Протеомика негизинен белокторду алардын массасынын зарядга болгон катышына негизделген аныктоо үчүн массалык спектрометрияны колдонот. Геномика ПЦР аркылуу ДНКны күчөтүү мүмкүнчүлүгүнөн пайда көрсө да, белокторду күчөтүүнүн түз эквиваленти жок, бул аз сандагы белокторду аныктоону протеомикада чоң кыйынчылыкка айлантат.
Геномика белгилүү бир биологиялык белгилердин же тукум куума оорулардын коркунучунун потенциалын аныктайт, бирок гендин чындыгында активдүү экендигин тастыктай албайт. Протеомика клетканын ичинде кайсы белоктор учурда иштеп жатканын көрсөтүү менен жок болгон байланышты камсыз кылат. Бул протеомиканы оорунун чыныгы механизмдерин жана организмдин белгилүү бир дары-дармектерге кандай жооп кайтарарын түшүнүү үчүн маанилүү кылат.
Гендердин саны белоктордун санына барабар.
Бул туура эмес, анткени бир ген альтернативдик сплайсинг жана посттрансляциялык модификациялар сыяктуу процесстер аркылуу көптөгөн ар кандай белокторду пайда кыла алат. Адамдарда болжол менен 20 000 ген бар, бирок уникалдуу белок варианттарынын саны бир миллиондон ашат деп болжолдонууда.
Геномика протеомикага караганда маанилүүрөөк.
Экөө тең андан жогору эмес; алар ар кандай маалыматтарды беришет. Геномика бизге генетикалык коддун негизинде эмне "болушу мүмкүн" экенин айтып берет, ал эми протеомика бизге организмдин ичиндеги функционалдык деңгээлде эмне "болуп жатканын" айтып берет.
Денедеги ар бир клетканын геному ар башка.
Көп клеткалуу организмдин дээрлик ар бир клеткасында бирдей геномдук ырааттуулук бар. Тери клеткасын мээ клеткасынан айырмалап турган нерсе - бул ошол клетка тарабынан экспрессияланган белоктордун белгилүү бир жыйындысы (протеом).
ДНК тести ден соолуктун бардык натыйжаларын алдын ала айта алат.
ДНК тесттери бейімділикти көрсөткөнү менен, алар белоктордун диетага, стресске же патогендерге кандай реакция кылаарын түшүндүрө албайт. Протеомика көбүнчө геном гана болушу мүмкүн деп божомолдогон оорунун чыныгы өнүгүшүн көрүү үчүн талап кылынат.
Тукум куучулук тобокелдиктерди аныктоо, эволюциялык тектерди картага түшүрүү же түрдүн баштапкы схемасын түшүнүү керек болгондо геномиканы тандаңыз. Реалдуу убакыттагы биологиялык өзгөрүүлөрдү байкоо, оорунун биомаркерлерин аныктоо же айлана-чөйрөнүн факторлорунун клеткалык ден соолукка функционалдык таасирин түшүнүү керек болгондо протеомиканы тандаңыз.
Бул салыштыруу Борбордук нерв системасы (БНС) менен Перифериялык нерв системасынын (ПНС) ортосундагы негизги айырмачылыктарды изилдейт. Анда алардын уникалдуу анатомиялык түзүлүштөрү, маалыматты иштетүүдөгү жана берүүдөгү адистештирилген функциялары жана алардын негизги рефлекстерден баштап татаал когнитивдик ой жүгүртүүгө чейинки ар бир дене аракетин жөнгө салуу үчүн кандайча кызматташаары кеңири баяндалат.
Бул салыштыруу өздөрүнүн азык заттарын органикалык эмес булактардан өндүргөн автотрофтор менен энергия алуу үчүн башка организмдерди керектөөгө аргасыз болгон гетеротрофтордун ортосундагы фундаменталдык биологиялык айырмачылыкты изилдейт. Бул ролдорду түшүнүү энергиянын глобалдык экосистемалар аркылуу кантип агып, Жердеги жашоону кантип колдоп жатканын түшүнүү үчүн абдан маанилүү.
Бул салыштыруу бөтөн заттын бар экендигин билдирген молекулярдык триггерлер болгон антигендер менен аларды нейтралдаштыруу үчүн иммундук система тарабынан өндүрүлгөн атайын белоктор болгон антителолордун ортосундагы байланышты тактайт. Бул кулпу жана ачкыч өз ара аракеттенүүнү түшүнүү организмдин коркунучтарды кантип аныктап, таасир же вакцинация аркылуу узак мөөнөттүү иммунитетти кантип кураарын түшүнүү үчүн абдан маанилүү.
Бул салыштыруу адамдын кан айлануу системасынын эки негизги өткөргүчү болгон артериялар менен веналардын ортосундагы структуралык жана функционалдык айырмачылыктарды деталдуу баяндайт. Артериялар жүрөктөн агып жаткан жогорку басымдагы кычкылтек менен байытылган канды өткөрүүгө ылайыкташтырылган болсо, веналардын бир тараптуу клапандар системасын колдонуу менен төмөнкү басым астында кычкылтексиз канды кайтарууга адистешкен.
Бул салыштыруу клеткалык дем алуунун эки негизги жолун деталдуу түрдө баяндайт, максималдуу энергия алуу үчүн кычкылтекти талап кылган аэробдук процесстерди кычкылтек жетишсиз чөйрөдө пайда болгон анаэробдук процесстер менен салыштырат. Бул зат алмашуу стратегияларын түшүнүү ар кандай организмдердин, ал тургай ар кандай адамдын булчуң талчаларынын биологиялык функцияларды кантип иштетээрин түшүнүү үчүн абдан маанилүү.
